Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARFGAP3Q9NP61 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms