Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM4Q9C037 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms