Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM79Q9BSE2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms