Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms