Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms