Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC12Q8WUD4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms