Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF1

GLIS1, Zinc finger protein GLIS1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1Q8NBF1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLIS1Q8NBF1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GLIS1Q8NBF1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms