Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms