Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTOP1Q7RTM1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms