Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL17Q6UXB2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms