Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RTL6Q6ICC9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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