Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BRMS1LQ5PSV4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms