Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC142Q17RM4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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