Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC18A3Q16572 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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