Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS72Q15906 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms