Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKIV2LQ15477 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms