Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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