Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms