Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK16Q00536 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms