Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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EFNB1P98172 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EFNB1P98172 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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