Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR1P84550 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms