Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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