Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLE2P56282 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLE2P56282 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLE2P56282 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLE2P56282 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLE2P56282 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLE2P56282 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms