Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms