Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK1EP49674 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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