Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA8P48165 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA8P48165 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA8P48165 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA8P48165 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA8P48165 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA8P48165 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA8P48165 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms