Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANGAP1P46060 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANGAP1P46060 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms