Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAGEA4P43358 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAGEA4P43358 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms