Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCAMP43121 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms