Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms