Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYT1P21579 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT1P21579 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT1P21579 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT1P21579 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT1P21579 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT1P21579 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms