Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMNB1P20700 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms