Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPCAMP16422 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms