Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL5P13501 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms