Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC4A1P02730 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms