Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms