Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF10O15013 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms