Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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