Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms