Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms