Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9Y3F1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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