Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms