Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REREQ9P2R6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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