Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms