Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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