Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDAC8Q9BY41 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms