Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms