Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NIPSNAP1Q9BPW8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NIPSNAP1Q9BPW8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NIPSNAP1Q9BPW8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NIPSNAP1Q9BPW8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NIPSNAP1Q9BPW8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NIPSNAP1Q9BPW8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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