Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SUSD3Q96L08 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUSD3Q96L08 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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