Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms